MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Buchnera aphidicola str. Ua (Uroleucon ambrosiae) plasmid pTrp

Total Repeats: 47

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017260	A	9	9	499	507	100 %	0 %	0 %	0 %	384228025
2	NC_017260	TAT	2	6	530	535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228025
3	NC_017260	TAT	2	6	571	576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228025
4	NC_017260	CAG	2	6	583	588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384228025
5	NC_017260	TAA	2	6	593	598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228025
6	NC_017260	GAAAC	2	10	599	608	60 %	0 %	20 %	20 %	384228025
7	NC_017260	A	6	6	656	661	100 %	0 %	0 %	0 %	384228025
8	NC_017260	TC	4	8	682	689	0 %	50 %	0 %	50 %	384228025
9	NC_017260	AAT	2	6	753	758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228025
10	NC_017260	AATTT	2	10	768	777	40 %	60 %	0 %	0 %	384228025
11	NC_017260	TGA	2	6	800	805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228025
12	NC_017260	A	6	6	811	816	100 %	0 %	0 %	0 %	384228025
13	NC_017260	TATCAA	2	12	820	831	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384228025
14	NC_017260	A	6	6	877	882	100 %	0 %	0 %	0 %	384228025
15	NC_017260	T	6	6	897	902	0 %	100 %	0 %	0 %	384228025
16	NC_017260	ATT	2	6	941	946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228025
17	NC_017260	AT	3	6	979	984	50 %	50 %	0 %	0 %	384228025
18	NC_017260	TTTA	2	8	988	995	25 %	75 %	0 %	0 %	384228025
19	NC_017260	TTA	2	6	1005	1010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228025
20	NC_017260	AAAC	2	8	1026	1033	75 %	0 %	0 %	25 %	384228025
21	NC_017260	CAAA	2	8	1121	1128	75 %	0 %	0 %	25 %	384228025
22	NC_017260	AAG	2	6	1174	1179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384228025
23	NC_017260	ATCA	2	8	1217	1224	50 %	25 %	0 %	25 %	384228025
24	NC_017260	CAA	2	6	1227	1232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384228025
25	NC_017260	ATTC	2	8	1241	1248	25 %	50 %	0 %	25 %	384228025
26	NC_017260	AGT	2	6	1268	1273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228025
27	NC_017260	T	8	8	1287	1294	0 %	100 %	0 %	0 %	384228025
28	NC_017260	AAT	2	6	1338	1343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228025
29	NC_017260	T	6	6	1359	1364	0 %	100 %	0 %	0 %	384228025
30	NC_017260	ATT	2	6	1385	1390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228025
31	NC_017260	AAC	2	6	1422	1427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384228025
32	NC_017260	A	6	6	1484	1489	100 %	0 %	0 %	0 %	384228025
33	NC_017260	TAG	2	6	1514	1519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228025
34	NC_017260	AATT	2	8	1786	1793	50 %	50 %	0 %	0 %	384228025
35	NC_017260	GGT	2	6	1827	1832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384228025
36	NC_017260	TA	3	6	1893	1898	50 %	50 %	0 %	0 %	384228025
37	NC_017260	AGCAGG	2	12	1922	1933	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384228025
38	NC_017260	AGA	2	6	1958	1963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384228025
39	NC_017260	ATA	2	6	2067	2072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228026
40	NC_017260	TGT	2	6	2125	2130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384228026
41	NC_017260	ATT	2	6	2159	2164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228026
42	NC_017260	TTAA	2	8	2252	2259	50 %	50 %	0 %	0 %	384228026
43	NC_017260	AGA	2	6	2274	2279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384228026
44	NC_017260	TGG	2	6	2329	2334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384228026
45	NC_017260	ACG	2	6	2388	2393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384228026
46	NC_017260	CTG	2	6	2577	2582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384228026
47	NC_017260	A	6	6	2643	2648	100 %	0 %	0 %	0 %	384228026

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.